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技術(shù)文章 / article
子宮內(nèi)膜癌精準(zhǔn)分子分型標(biāo)準(zhǔn)品，助力POLE基因檢測(cè)
原載自：linai8768.com[技術(shù)資料頻道] 2024-04-11 瀏覽次數(shù)：3156
2013年美國(guó)癌癥基因組圖譜（TCGA），依據(jù)子宮內(nèi)膜癌全基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組等多組學(xué)檢測(cè)結(jié)果，將其分為POLE突變型、微衛(wèi)星不穩(wěn)定突變型、低拷貝數(shù)型和高拷貝數(shù)型等4種類型。2023年國(guó)際婦產(chǎn)科聯(lián)盟（International Federation of Gynecology and Obstetrics，F(xiàn)IGO）分期建議，所有的子宮內(nèi)膜癌EC患者均應(yīng)完善分子分型檢測(cè)。
圖1 子宮內(nèi)膜癌分子分型檢測(cè)推薦路線
2024年1月29日，美國(guó)國(guó)立綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)（National Comprehensive Cancer Network，NCCN ）同時(shí)對(duì)結(jié)腸癌和直腸癌指南進(jìn)行了更新，升級(jí)為2024.V1版本。相比于2023 V6版NCCN指南，2024 V1版增加了POLE 和POLD1突變、RET融合基因的分子檢測(cè)說(shuō)明。
POLE基因簡(jiǎn)介
POLE 基因位于12q24. 33，由63762個(gè)堿基對(duì)組成，包含51個(gè)外顯子序列，POLE基因編碼 DNA聚合酶 Polε的催化亞基，該亞基包含催化結(jié)構(gòu)域和核酸外切酶結(jié)構(gòu)域，對(duì) DNA復(fù)制過(guò)程中的校對(duì)功能至關(guān)重要。當(dāng)POLE基因的外切酶結(jié)構(gòu)域發(fā)生致病性突變、導(dǎo)致該蛋白在 DNA復(fù)制過(guò)程中無(wú)法及時(shí)執(zhí)行錯(cuò)配校對(duì)功能時(shí)，腫瘤細(xì)胞的基因組會(huì)在細(xì)胞增殖過(guò)程中積累大量的復(fù)制錯(cuò)誤，從而表現(xiàn)為超過(guò)正常細(xì)胞（通常<10個(gè)突變/Mb）10~100 倍以上的突變頻率。只有在腫瘤中檢出位于POLE基因核酸外切酶結(jié)構(gòu)域（第9~14外顯子）的致病性突變，才能被診斷為POLE突變型，Pole基因突變可導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生。
目前研究發(fā)現(xiàn)，盡管POLE基因突變的腫瘤形態(tài)學(xué)高度惡性，但預(yù)后良好，對(duì)免疫制劑具有良好反應(yīng)。
POLE基因變異
POLE突變包括體系突變和胚系突變，其中體系突變率為 6%~10%，胚系突變率 0.25%~4%，胚系突變具有遺傳性。POLE基因突變類型包括核苷酸的重復(fù)、缺失和插入，大多數(shù)突變是非整倍體。POLE基因突變檢測(cè)包括熱點(diǎn)突變或POLE基因核酸外切酶結(jié)構(gòu)域致病性突變。POLE基因核酸外切酶結(jié)構(gòu)域包含外顯子 9~14，80%以上的致病性變異發(fā)生在 9號(hào)和13號(hào)外顯子。目前已確定包括 P286R、V411L、S297F、S459F、A456P、F367S、L424I、M295R、P436R、M444K 和 D368Y 位點(diǎn)在內(nèi)的11個(gè) POLE基因的致病性突變位點(diǎn)。新的可能致病性突變位點(diǎn)正在被陸續(xù)報(bào)道，少數(shù)研究已經(jīng)證實(shí)了外切酶結(jié)構(gòu)域以外的致病性突變，但其致病作用有待進(jìn)一步證實(shí)。
POLE基因檢測(cè)
目前POLE基因突變的檢測(cè)方法主要包括Sanger測(cè)序和第二代高通量測(cè)序（NGS）。Sanger測(cè)序的優(yōu)勢(shì)是成本低、精確度高，對(duì)于已知變異位點(diǎn)的檢測(cè)非常經(jīng)濟(jì)和高效，可以作為檢測(cè)的金標(biāo)準(zhǔn)，但最大的局限性是覆蓋度和靈敏度低，不能檢測(cè)到未知變異位點(diǎn)。NGS 技術(shù)具有通量大、精準(zhǔn)度高和信息量豐富等優(yōu)點(diǎn)，但由于檢測(cè)成本高、周期長(zhǎng)，限制了NGS在臨床實(shí)踐中的推廣應(yīng)用。此外，為降低檢測(cè)成本并提高檢測(cè)靈敏度，還可以對(duì)目標(biāo)序列進(jìn)行雜交捕獲或擴(kuò)增子富集后進(jìn)行靶向測(cè)序（targeted sequencing）。2021版《子宮內(nèi)膜癌分子檢測(cè)中國(guó)專家共識(shí)》推薦條件允許的情況下對(duì)POLE基因9~14號(hào)外顯子區(qū)域進(jìn)行高通量靶片段測(cè)序，尤其是POLE基因核酸外切酶結(jié)構(gòu)域的致病突變。
子宮內(nèi)膜癌精準(zhǔn)分子分型標(biāo)準(zhǔn)品
科佰生物推出了子宮內(nèi)膜癌精準(zhǔn)分子分型標(biāo)準(zhǔn)品，助力POLE基因檢測(cè)。部分?jǐn)?shù)據(jù)展示如下：
AI-Edigene® POLE p.S297F Reference Standard Plus CBP10682
AI-Edigene® POLE p.V411L Reference Standard Plus CBP10684
AI-Edigene® POLE p.P286R Reference Standard Plus CBP10685
AI-Edigene® POLE p.F367S Reference Standard Plus CBP10689
AI-Edigene® POLE p.L424I Reference Standard Plus CBP10690
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